生物医学废物源自人类或动物保健、医学研究、医学教学设施、实验室和其他设施。这些废物流的一部分具有传染性或潜在传染性，对公众健康和环境构成潜在危害。
在生物医学废物被回收或填埋之前，必须以无害的方式处理，并且必须彻底消毒有毒和传染性物质。一般来说，医疗废物的无害化处理包括以下方法：
焚烧
这是一种高温热处理过程，在受控条件下燃烧废物以将其转化为惰性物质和气体。焚烧炉可以是燃油或电力，也可以是两者的组合。广义上，医院废物使用三种类型的焚烧炉：多炉膛型、回转窑型和受控空气型。所有类型都可以有一次和二次燃烧室以确保最佳燃烧。
建议对人体解剖废物、动物废物、细胞毒性药物、废弃药物和污染废物进行焚烧。
高压灭菌器处理
这是一种在压力下进行蒸汽灭菌的过程。这是一种低热过程，其中蒸汽与废料直接接触，持续时间足以对材料进行消毒。有三种类型：重力式、预真空式和蒸馏式。
在第一种类型（重力式）中，空气仅借助重力排出。该系统在 121 摄氏度的温度和 15 psi 的蒸汽压力下运行 60-90 分钟。真空泵用于从高压灭菌器系统中抽出空气，以便将时间周期缩短至 30-60 分钟。它在大约 132 摄氏度的温度下运行。蒸馏式高压灭菌器设计用于处理更大的体积，并在更高的蒸汽温度和压力下运行。
高压灭菌器处理已被推荐用于微生物学和生物技术废物、废弃锐器、脏污和固体废物。这项技术使某些类别的生物医学废物变得无害且无法识别，因此处理后的残留物可以填埋。
微波处理过程
微波处理是一种湿热消毒技术，但与其他从外部加热废物的热处理系统不同，微波从内到外加热目标材料，提供高水平的消毒。
首先将输入材料放入粉碎机。切碎的材料被推入处理室，在那里用高温蒸汽润湿。然后，材料由螺旋输送机运送到一系列（通常为 4-6 个）传统微波发生器下方，将材料加热到 95-100 摄氏度，并在至少 30 分钟的停留时间内均匀消毒材料，总周期为 50 分钟。第二台粉碎机将材料进一步碎裂成无法识别的颗粒，然后自动排放到传统/一般废物容器中。只要小心谨慎地完成微波处理，这种处理过的材料就可以填埋。在现代版本中，过程控制已计算机化，以实现平稳有效的控制。
微波技术具有某些优势，例如，无有害气体排放（当提供足够的容器和过滤器时）、无液体排放、不需要化学品、废物量减少（由于粉碎和水分损失）和操作员安全（由于垃圾箱自动提升到料斗中，因此无需手动接触废物袋）。
化学消毒
建议对废弃锐器、固体和液体废物以及化学废物进行这种处理。化学处理涉及使用至少 1% 次氯酸盐溶液，接触时间至少为 30 分钟或其他等效化学试剂，例如酚类化合物、碘、六氯酚、碘-酒精或甲醛-酒精组合等。最好对废物进行预粉碎，以便更好地与废料接触。
将废物粉碎，通过10％次氯酸盐溶液（dixichlor），然后进行更精细的粉碎和干燥。
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